{"id":12820,"date":"2017-08-01T18:06:58","date_gmt":"2017-08-01T15:06:58","guid":{"rendered":"http:\/\/109.232.216.219\/~bilimvegelecek\/?p=12820"},"modified":"2018-02-07T19:12:52","modified_gmt":"2018-02-07T16:12:52","slug":"biyologlar-gen-duzenleme-yontemleriyle-dnaya-film-kaydetti","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/bilimvegelecek.com.tr\/index.php\/2017\/08\/01\/biyologlar-gen-duzenleme-yontemleriyle-dnaya-film-kaydetti","title":{"rendered":"Biyologlar gen d\u00fczenleme y\u00f6ntemleriyle DNA\u2019ya film kaydetti!"},"content":{"rendered":"

\u0130nternet kullan\u0131c\u0131lar\u0131n\u0131n filmlerini depolayacaklar\u0131 \u00e7e\u015fitli se\u00e7enekler vard\u0131, \u015fimdi biyologlar da yeni bir yol buldu. Ara\u015ft\u0131rmac\u0131lar, bir filmi\u00a0Escherichia coli<\/em>\u00a0bakterisinin genomuna kodlamak i\u00e7in CRISPR-Cas gen d\u00fczenleme y\u00f6ntemini kulland\u0131.<\/p>\n

Boston Massachusetts\u2019daki Harvard T\u0131p Fak\u00fcltesi\u2019nden sentetik biyolog Seth Shipman, 12 Temmuz\u2019da\u00a0Nature<\/em>\u2019da yay\u0131mlanan makalesinde, bir dizi olay\u0131 kareler olarak kodlayabilen h\u00fccresel video kay\u0131t sistemlerinin olu\u015fturulmas\u0131 yolunda bir ad\u0131m att\u0131klar\u0131n\u0131 belirtiyor. Shipman, beyin geli\u015fimini incelerken beyindeki h\u00fccrelerin farkl\u0131 kimlikleri nas\u0131l ele ge\u00e7irdi\u011fini kay\u0131t alt\u0131na alan bir teknik bulunmamas\u0131 nedeniyle hayal k\u0131r\u0131kl\u0131\u011f\u0131na u\u011frad\u0131. Bu da ona h\u00fccresel kay\u0131t cihazlar\u0131 yapma imk\u00e2n\u0131n\u0131 ke\u015ffetmesinde ilham kayna\u011f\u0131 oldu. \u201cH\u00fccrelerin, her t\u00fcrl\u00fc ayr\u0131cal\u0131kl\u0131 bilgiye eri\u015fimi vard\u0131r\u201d diyor. \u201cMolek\u00fcler kay\u0131t i\u015flemini geli\u015fmekte olan sinir sisteminde ve kay\u0131t bilgileri esnas\u0131nda yapmak istiyorum.\u201d<\/p>\n

CRISPR k\u0131rp\u0131\u011f\u0131<\/strong><\/p>\n

Bununla birlikte, b\u00f6yle bir sistemi geli\u015ftirmek i\u00e7in ekibinin bir h\u00fccredeki y\u00fczlerce enstanteneyi kaydetmeye yarayan bir y\u00f6ntem olu\u015fturmas\u0131 gerekecektir. Shipman ve Harvard\u2019dan genetik\u00e7i George Church ile birlikte ekip arkada\u015flar\u0131, ara\u015ft\u0131rmac\u0131lar\u0131n genomlar\u0131 nispeten kolay ve hassas bir \u015fekilde de\u011fi\u015ftirmelerini sa\u011flayan bilinen en iyi y\u00f6ntem CRISPR-Cas sistemini kulland\u0131.<\/p>\n

Shipman ve ekibi, i\u015fgalci vir\u00fcslerden DNA par\u00e7ac\u0131klar\u0131n\u0131 yakalamak ve onlar\u0131 ana genomdaki d\u00fczenli bir dizide saklamak i\u00e7in kulland\u0131. Do\u011fada, bu par\u00e7ac\u0131klar daha sonra i\u015fgalcinin DNA\u2019s\u0131n\u0131 kesmek i\u00e7in bir enzimi hedef al\u0131yor. Ekip, bu par\u00e7ac\u0131klar\u0131n bir resimdeki piksellere kar\u015f\u0131l\u0131k gelmesi i\u00e7in sistemi tasarlad\u0131. Ara\u015ft\u0131rmac\u0131lar, her pikselin kar\u015f\u0131l\u0131\u011f\u0131n\u0131 kodlayarak resimdeki pozisyonunu belirten 33 DNA harfine yazd\u0131lar. Filmin her karesi 104 DNA fragman\u0131ndan olu\u015fuyordu.<\/p>\n

Ara\u015ft\u0131rmac\u0131lar\u0131n se\u00e7tikleri film, \u0130ngiliz foto\u011fraf\u00e7\u0131 Eadweard Muybridge\u2019in \u0130nsan ve Hayvan Lokomotif serisinden uyarlanan be\u015f kareden olu\u015fuyordu. Foto\u011fraflar 1887\u2019de Annie G. adl\u0131 bir k\u0131sra\u011f\u0131 d\u00f6rtnala giderken g\u00f6steriyordu.<\/p>\n

Ekip, be\u015f g\u00fcn s\u00fcreyle, DNA\u2019y\u0131\u00a0E. coli<\/em>\u2019ye g\u00fcnde bir kareyle (frame) tan\u0131tt\u0131. Daha sonra, imaj\u0131 iyile\u015ftirmek i\u00e7in bir bakteri pop\u00fclasyonundaki CRISPR b\u00f6lgelerini diziledi. \u00c7\u00fcnk\u00fc, CRISPR sistemi, DNA par\u00e7ac\u0131klar\u0131n\u0131 s\u0131rayla ekledi\u011finden, dizideki her par\u00e7an\u0131n konumu, par\u00e7an\u0131n ait oldu\u011fu orijinal kareyi belirlemek i\u00e7in kullan\u0131labilirdi.<\/p>\n

\"\"Kodlama devrimi<\/strong><\/p>\n

Sistem, Shipman\u2019\u0131n beyni incelerken hayal etti\u011fi kaydedici olma yolundan uzakta. \u0130svi\u00e7re Federal Teknoloji Enstit\u00fcs\u00fc\u2019nden biyom\u00fchendis Randall Platt, bu noktaya ula\u015fmak i\u00e7in \u00f6nemli teknolojik geli\u015fmelere ihtiya\u00e7 duyuldu\u011funu belirtti. \u00c7\u00fcnk\u00fc, her h\u00fccre tek bir kareden fazla DNA par\u00e7ac\u0131\u011f\u0131 alamaz, filmdeki bilgiler h\u00fccre pop\u00fclasyonlar\u0131nda saklan\u0131r. Ve kimse hen\u00fcz CRISPR dizilerini memeli h\u00fccrelerine aktarmad\u0131. \u201cS\u0131n\u0131rlamalarla dolu olsa da, yapt\u0131klar\u0131 i\u015f \u00f6nc\u00fc bir i\u015ftir\u201d diyor, ve ekliyor, \u201czariftir de.\u201d<\/p>\n

Kuzey Karolina, Durham\u2019da Semiconductor Research Corporation\u2019dan Victor Zhirnov, \u00e7al\u0131\u015fmay\u0131 \u201cdevrimci\u201d olarak nitelendiriyor ve kendi ara\u015ft\u0131rma kurumunda bu teknikle u\u011fra\u015fmay\u0131 umuyor. \u201cSanki 1903\u2019te u\u00e7an ilk u\u00e7ak gibi, sadece bir merakt\u0131,\u201d diyor Zhirnov. \u201cFakat on y\u0131l sonra neredeyse bug\u00fcnk\u00fc u\u00e7aklar\u0131m\u0131z yap\u0131ld\u0131.\u201d<\/p>\n

Kayd\u0131n gif g\u00f6r\u00fcnt\u00fcs\u00fc<\/strong>:\u00a0https:\/\/goo.gl\/pQ6CQE<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

\u0130nternet kullan\u0131c\u0131lar\u0131n\u0131n filmlerini depolayacaklar\u0131 \u00e7e\u015fitli se\u00e7enekler vard\u0131, \u015fimdi biyologlar da yeni bir yol buldu. Ara\u015ft\u0131rmac\u0131lar, bir filmi\u00a0Escherichia coli\u00a0bakterisinin genomuna kodlamak i\u00e7in CRISPR-Cas gen d\u00fczenleme y\u00f6ntemini kulland\u0131. Boston Massachusetts\u2019daki Harvard T\u0131p Fak\u00fcltesi\u2019nden sentetik biyolog Seth Shipman, 12 Temmuz\u2019da\u00a0Nature\u2019da yay\u0131mlanan makalesinde, bir dizi olay\u0131 kareler olarak kodlayabilen h\u00fccresel video kay\u0131t sistemlerinin olu\u015fturulmas\u0131 yolunda bir ad\u0131m att\u0131klar\u0131n\u0131 belirtiyor. […]<\/p>\n","protected":false},"author":761,"featured_media":12821,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[1125,19,21],"tags":[197,272,1103,1104],"class_list":["post-12820","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-162-sayi","category-bilim-gundemi","category-biyoloji","tag-biyoloji","tag-dna","tag-film","tag-kodlama"],"acf":[],"aioseo_notices":[],"aioseo_head":"\n\t\t\n\t\n\t\n\t\n\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t